Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC073254.1-206ENST00000617813 907 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RAB3IP-218ENST00000553099 2674 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LAMA3-207ENST00000587184 5007 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01886-202ENST00000443205 1539 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MCM8-203ENST00000378886 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC011330.1-201ENST00000510070 3235 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 VPS8-204ENST00000424463 2359 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TGIF2LY-201ENST00000321217 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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