Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTP4A2Q12974 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms