Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCAMP43121 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCAMP43121 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms