Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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