Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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