Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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SH3BP1Q9Y3L3 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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