Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms