Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MIS18AQ9NYP9 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MIS18AQ9NYP9 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms