Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LRRIQ1Q96JM4 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms