Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HIC2Q96JB3 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms