Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FXNQ16595 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FXNQ16595 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FXNQ16595 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms