Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TAF1AQ15573 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms