Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms