Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPL22P11-201ENST00000434894 385 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SMCO1Q147U7 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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