Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms