Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CUL1Q13616 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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