Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms