Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms