Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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HOXC13P31276 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXC13P31276 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXC13P31276 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXC13P31276 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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