Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms