Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC007422.2-201ENST00000419809 167 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms