Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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