Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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