Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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CLIP2Q9UDT6 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CLIP2Q9UDT6 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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CLIP2Q9UDT6 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLIP2Q9UDT6 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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