Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FANCFQ9NPI8 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms