Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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FOXQ1Q9C009 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
FOXQ1Q9C009 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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