Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms