Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 LINC02181-201ENST00000430050 4083 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AL359852.1-201ENST00000624609 2197 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC024610.2-205ENST00000584758 1567 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 UPRT-202ENST00000373379 2234 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 STYK1-201ENST00000075503 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC092681.2-201ENST00000565102 3044 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AL591222.1-201ENST00000568063 3844 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 KLHL7-AS1-201ENST00000419813 2564 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 TRIM39-202ENST00000376659 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AP000781.1-201ENST00000534162 311 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 LINC00710-219ENST00000635054 938 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 TPM1-233ENST00000610733 3957 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AC027045.2-201ENST00000634974 1571 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 COL17A1-203ENST00000393211 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 GMPR2-203ENST00000399440 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 DLGAP1-AS2-201ENST00000572856 2261 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 ABI2-211ENST00000422511 2718 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
HLA-CQ95604 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms