Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC93Q567U6 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms