Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC073111.1-201ENST00000497366 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090519.1-201ENST00000508195 1002 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF317P1-201ENST00000521453 1027 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC010768.3-201ENST00000525465 792 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000924.1-201ENST00000526605 720 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC118658.1-201ENST00000560221 334 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PMM2-213ENST00000566983 907 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000223.1-201ENST00000567517 557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR3689D2-201ENST00000580187 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 VDAC3P1-201ENST00000604654 850 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Z73429.1-201ENST00000610170 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TTC28-AS1_4.1-201ENST00000619378 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SGK1-211ENST00000475719 1383 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CSTL1-201ENST00000246020 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC211476.4-201ENST00000275546 699 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HSPB3-201ENST00000302005 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GH2-201ENST00000332800 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TAC4-202ENST00000334568 675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GH1-202ENST00000342364 537 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CSTL1-202ENST00000347397 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP22-201ENST00000365097 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CD160-202ENST00000369288 1424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RAD51B-201ENST00000390683 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PYY3-201ENST00000419078 213 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL29P28-201ENST00000421928 472 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms