Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CDKN2AIPNLP3-201ENST00000418361 309 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PLA2G1B-203ENST00000549767 562 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms