Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
USF2Q15853 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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