Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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CHD4Q14839 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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CHD4Q14839 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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CHD4Q14839 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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CHD4Q14839 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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