Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms