Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL357127.1-201ENST00000451295 438 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC091096.1-201ENST00000521955 614 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 EIF4A1P9-201ENST00000576035 1207 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL031281.2-201ENST00000606754 748 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AL359834.1-201ENST00000635660 638 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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CLN3Q13286 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 MAPK10-240ENST00000639175 2596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 DCLRE1C-203ENST00000378242 1933 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CLN3Q13286 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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