Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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