Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPN13Q12923 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PTPN13Q12923 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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