Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SCN4AP35499 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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