Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD13P35453 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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