Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD12P35452 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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