Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CASQ1P31415 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CASQ1P31415 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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