Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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HOXD10P28358 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
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HOXD10P28358 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD10P28358 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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