Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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C9orf172C9J069 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
C9orf172C9J069 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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