Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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C17orf47Q8NEP4 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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C17orf47Q8NEP4 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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C17orf47Q8NEP4 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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C17orf47Q8NEP4 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
C17orf47Q8NEP4 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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