Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms