Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CTF1Q16619 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 DHRS9-203ENST00000421653 1044 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC006159.1-201ENST00000452009 386 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC011509.2-201ENST00000592263 627 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CTF1Q16619 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms