Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms