Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL3Q13618 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms