Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MTMR3Q13615 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MTMR3Q13615 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms