Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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FOXF1Q12946 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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